V oblasti vedy rastlín hrá presná a účinná detekcia RNA kľúčovú úlohu pri porozumení fyziológie rastlín, diagnostiky chorôb a genetického výskumu. Tradičné metódy zosilnenia a detekcie RNA často prichádzajú s obmedzeniami, ako sú dlhé časy spracovania, zložité požiadavky na vybavenie a potreba špecializovaných laboratórií. To je miesto, kde RNA izotermická zosilnenie súprava súkra ako hra - menič. Ako dodávateľ týchto súprav som nadšený, že môžem preskúmať, ako sa pri detekcii rastlinnej RNA vykonáva súprava izotermálnej amplifikácie RNA.
Princíp izotermálnej amplifikácie RNA
Predtým, ako sa ponorí do jej výkonu v detekcii rastlinnej RNA, je nevyhnutné pochopiť princíp súpravy Izotermálnej zosilňovacej súpravy RNA. Na rozdiel od bežne známej polymerázovej reťazovej reakcie (PCR), ktorá vyžaduje tepelné cyklovanie medzi rôznymi teplotami na denaturáciu DNA, žíhanie a predĺženie, sa izotermálna amplifikácia vyskytuje pri konštantnej teplote. Táto jednoduchosť eliminuje potrebu drahých tepelných cyklerov, vďaka čomu je prístupnejšia pre - stránky alebo zdroj - obmedzené nastavenia.
Existuje niekoľko techník izotermálnej amplifikácie, ako napríklad izotermálna amplifikácia sprostredkovaná slučkou (LAMP) a amplifikácia založená na nukleových kyselinách (NASBA), ktoré sa často používajú v týchto súpravách. Lampa napríklad používa sadu špeciálnych primérov, ktoré rozpoznávajú viacero špecifických sekvencií na cieľovej RNA. Pomocou DNA polymerázy - vytlačujúca vlákno môže rýchlo amplifikovať cieľovú RNA za izotermálnych podmienok, čo produkuje veľké množstvo amplikónov DNA, ktoré sa dajú ľahko zistiť.
Výhody detekcie rastlinnej RNA
Citlivosť
Jedným z kľúčových ukazovateľov výkonnosti akejkoľvek metódy detekcie RNA je citlivosť. Súprava na izotermálnu amplifikáciu RNA preukázala vynikajúcu citlivosť pri detekcii rastlinnej RNA. V štúdiách rastlín môžu byť aj stopové množstvá špecifickej RNA, ako sú tie z vírusových infekcií alebo zriedkavé génové expresie, rozhodujúcimi informáciami. Proces izotermálnej amplifikácie môže exponenciálne zosilniť tieto RNA s nízkym počtom výskytov na zistiteľné úrovne.
Napríklad pri detekcii rastlinných vírusov, ktoré často existujú vo veľmi nízkych titroch v počiatočných štádiách infekcie, môže súprava vyzdvihnúť vírusovú RNA s vysokou presnosťou. Toto včasné odhalenie je nevyhnutné na zabránenie šírenia chorôb rastlín a zabezpečení zdravia plodín.
Špecifickosť
Špecifickosť je ďalším kľúčovým aspektom. Priméry použité v súprave Izotermálnej amplifikácie RNA sú starostlivo navrhnuté tak, aby rozpoznávali iba cieľovú rastlinnú RNA. Táto špecifickosť vysokej úrovne znižuje šance na falošné - pozitívne výsledky. V komplexnom prostredí RNA rastlín, kde je veľa endogénnych RNA z rôznych génov a organizmov, je schopnosť špecificky zamerať požadovanú RNA sekvenciu.
Napríklad pri rozlišovaní medzi úzko príbuznými rastlinnými vírusmi alebo detekciou konkrétneho kmeňa vírusu môžu špecifické priméry presne odlíšiť cieľovú RNA od ostatných a poskytnúť spoľahlivé výsledky na identifikáciu patogénov rastlín.
Rýchlosť
Rýchlosť je pozoruhodnou výhodou súpravy Izotermálnej amplifikácie RNA pri detekcii rastlinnej RNA. Tradičné metódy založené na PCR môžu trvať hodiny, vrátane prípravy vzoriek, tepelného cyklu a analýzy výsledkov. Naopak, izotermická amplifikácia môže dosiahnuť významnú amplifikáciu už za 30 - 60 minút.
Tento rýchly čas obratu je mimoriadne prospešný v poľnohospodárskych prostrediach, kde je potrebné urobiť rýchle rozhodnutia týkajúce sa riadenia chorôb rastlín. Napríklad vo veľkom meradle skleníka alebo farmy, ak rastlina vykazuje príznaky potenciálnej vírusovej infekcie, môže RNA izotermálna amplifikačná súprava poskytnúť výsledky do jednej hodiny, čo umožňuje poľnohospodárom podniknúť okamžité opatrenia na zabránenie šírenia choroby.
Jednoduchosť
Jednoduchosť súpravy Izotermálnej zosilňovacej súpravy RNA je používateľom - priateľský, dokonca aj pre používateľov, ktorí nie sú odborníkmi. Pretože pracuje pri konštantnej teplote, nie je potrebné nastaviť komplexné parametre tepelnej cyklistiky. Reakčné komponenty sú zvyčajne vopred zmiešané v súprave, čím sa počas experimentu znižujú šance na chyby.
Táto jednoduchosť znamená, že detekcia rastlinnej RNA sa môže vykonávať v teréne priamo v mieste odberu vzoriek rastlín. Napríklad chovateľ rastlín môže použiť súpravu priamo v teréne na rýchle premietanie pre prítomnosť požadovaných genetických znakov alebo chorôb v nových odrodách rastlín.
Rôzne detekčné formáty
Naša spoločnosť ponúka celý rad detekčných formátov, ktoré vyhovujú rôznym potrebám pri detekcii rastlinnej RNA.
Testovací prúžok nukleových kyselín
TenMIRA DNA izotermálna rýchla amplifikačná súprava Nukleový kyselina Testovací pásPoskytuje jednoduchý a vizuálny spôsob detekcie amplifikovanej rastlinnej RNA. Po izotermálnej amplifikačnej reakcii sa do testovacieho pásu pridá reakčný produkt. Podobne ako pri tehotenskom teste, viditeľná čiara na prúžku naznačuje pozitívny výsledok. Tento formát je mimoriadne pohodlný pre detekciu stránok na stránkach, pretože na čítanie výsledkov nevyžaduje žiadne drahé vybavenie. Môže sa používať vo vzdialených poľnohospodárskych oblastiach alebo počas poľných prieskumov, kde sú potrebné rýchle a priame výsledky.
Detekcia fluorescencie
TenMIRA DNA Izotermálna rýchla amplifikačná súprava FluorescenciaVyužíva fluorescenčné farbivá na detekciu amplifikovanej rastlinnej RNA. Počas procesu izotermálnej amplifikácie sa fluorescenčné farbivo viaže na novo syntetizované amplikóny DNA a zvýšenie intenzity fluorescencie sa môže merať pomocou fluorometrov. Táto metóda je kvantitatívnejšia v porovnaní s metódou testovacieho pásu. Môže poskytovať informácie o množstve cieľovej RNA vo vzorke, ktorá je užitočná pre štúdie hladín génovej expresie alebo titrov vírusov v rastlinách.
Základný formát
TenMIRA DNA izotermálna rýchla amplifikačná súprava základnáje tradičnejší formát, ktorý sa dá použiť v spojení s inými detekčnými metódami, ako je gélová elektroforéza. Po izotermálnej amplifikácii sa môže reakčný produkt prevádzkovať na agarózovom géli, aby sa vizualizovali amplifikované pásy DNA. Tento formát je vhodný pre viac in -hĺbkových laboratórnych analýz, čo vedcom umožňuje ďalej študovať charakteristiky amplifikovanej RNA, ako je jej veľkosť a čistota.
Real - World Applications vo výskume rastlín
V genetickom inžinierstve rastlín sa na detekciu expresie transgénov v geneticky modifikovaných rastlinách používa súprava RNA izotermálna amplifikačná súprava. To pomáha vedcom rýchlo overiť, či sa zavedené gény správne prepisujú do RNA, čo je rozhodujúce pre úspech procesu genetickej modifikácie.
Na diagnostiku ochorenia rastlín, ako už bolo uvedené, je detekcia vírusovej alebo hubovej RNA v rastlinách nevyhnutná na prevenciu ohniskov choroby. Súpravu izotermálnej amplifikačnej súpravy RNA sa môže použiť na skríning veľkého počtu vzoriek rastlín v krátkom čase, čo umožňuje včasnú detekciu a včasné ošetrenie chorôb.
Pri šľachtení rastlín sa súprava môže použiť na detekciu špecifických RNA markerov spojených s požadovanými znakmi, ako je rezistencia na choroby alebo vysoký potenciál výnosu. Rýchla identifikácia rastlín s týmito vlastnosťami môžu chovatelia urýchliť proces šľachtenia a efektívnejšie vyvinúť nové odrody rastlín.
Povzbudzovanie kontaktu pre nákup
Súpravu izotermálnej amplifikačnej súpravy RNA ponúka vynikajúci výkon pri detekcii rastlinnej RNA z hľadiska citlivosti, špecifickosti, rýchlosti a jednoduchosti. Ak ste zapojení do výskumu rastlín, poľnohospodárstva alebo akejkoľvek oblasti súvisiacej s analýzou rastlinnej RNA, naše súpravy môžu byť pre vašu prácu neoceniteľným nástrojom. Pozývame vás, aby ste nás kontaktovali pre ďalšie informácie a diskutovali o vašich konkrétnych požiadavkách. Či už potrebujete veľký nákup pre výskumný projekt alebo malé množstvo na testovanie v teréne, sme pripravení poskytnúť vám najlepšie riešenia a podporu.
Odkazy
- Notomi T, Okayama H, Masubuchi H, a kol. Izotermálna amplifikácia DNA sprostredkovaná slučkou. Nukleové kyseliny Res. 2000; 28 (12): E63.
- Compton J. Amplifikácia nukleových kyselín - amplifikácia. Povaha. 1991; 350 (6313): 91 - 92.
- Goto N, Nikkuni K, Hase T. Detekcia rastlinných vírusov metódami založenými na nukleovej kyseline. J Gen Plant Pathol. 2009; 75 (6): 339 - 348.